治理与研究记忆
用途
保存跨会话状态以外的重要研究决定、用户审批、操作日志、检索路径和来源保护原则。本目录不应包含未经核验的历史定论。
文件与职责
checkpoints.md：原 Skill 三阶段九环节的人类审批记录；不得由 Codex 虚构已批准的决定。decisions.md：重要研究判断、改变方向、已否定解释及可复议条件。research-log.md：检索范围、来源操作、进度以及未完成工作。source-policy.md：原始材料保管、转录、许可及版本控制政策。bibliography.bib：引用管理入口（具体项目可与 Zotero 同步）。D-*.md：重要决定的编号卡片，用tools/new_item.py --kind decision新建。
约束
研究者批准必须来自实际明确授权；Codex 可以建议、记录、指出未决事项，不能越权批准。所有事实性判断需回到来源卡或学术史，不能把本目录记录当作独立证据。主题由根目录 topic.md 定义。